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國(guó)外常用的醫(yī)學(xué)類數(shù)據(jù)庫(kù)

1. 臨床與電子健康記錄（EHR）數(shù)據(jù)庫(kù)

• MIMIC-III/IV

• MIT推出的重癥監(jiān)護(hù)病房（ICU）患者數(shù)據(jù)庫(kù)，包含生命體征、實(shí)驗(yàn)室檢查、用藥記錄等（需申請(qǐng)?jiān)L問(wèn)）。

• 官網(wǎng)：https://mimic.mit.edu/

• eICU Collaborative Research Database

• Philips與MIT合作的多中心ICU數(shù)據(jù)庫(kù)，覆蓋美國(guó)多家醫(yī)院數(shù)據(jù)。

• UK Biobank

• 英國(guó)50萬(wàn)人的健康數(shù)據(jù)，包括臨床記錄、基因組、影像等（需申請(qǐng)）。

• 官網(wǎng)：https://www.ukbiobank.ac.uk/

• All of Us Research Program

• 美國(guó)NIH主導(dǎo)的百萬(wàn)級(jí)人群健康數(shù)據(jù)庫(kù)，涵蓋多樣化人群。

• 官網(wǎng)：https://allofus.nih.gov/

2. 基因組與生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

• NCBI GeneBank & dbGaP

• 美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心（NCBI）的基因序列數(shù)據(jù)庫(kù)和基因型-表型數(shù)據(jù)庫(kù)（需申請(qǐng)）。

• 官網(wǎng)：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

• TCGA (The Cancer Genome Atlas)

• 癌癥基因組數(shù)據(jù)，涵蓋33種癌癥的分子特征和臨床數(shù)據(jù)。

• 官網(wǎng)：https://www.cancer.gov/tcga

• GTEx (Genotype-Tissue Expression)

• 正常人體組織的基因表達(dá)與調(diào)控?cái)?shù)據(jù)。

• 官網(wǎng)：https://gtexportal.org/

• ClinVar

• 疾病相關(guān)基因變異的臨床解讀數(shù)據(jù)庫(kù)。

3. 醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫(kù)

• The Cancer Imaging Archive (TCIA)

• 癌癥影像數(shù)據(jù)集（CT/MRI/PET等），與TCGA配套。

• 官網(wǎng)：https://www.cancerimagingarchive.net/

• CheXpert

• 斯坦福大學(xué)的胸部X光數(shù)據(jù)集，用于肺炎等疾病檢測(cè)。

• OASIS

• 阿爾茨海默病研究的腦部MRI數(shù)據(jù)集。

• 官網(wǎng)：https://www.oasis-brains.org/

4. 藥物與化合物數(shù)據(jù)庫(kù)

• PubChem

• 化學(xué)化合物、藥物活性及分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)。

• 官網(wǎng)：https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

• DrugBank

• 藥物靶點(diǎn)、作用機(jī)制和藥代動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù)。

• 官網(wǎng)：https://go.drugbank.com/

• ChEMBL

• 歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室（EMBL）的藥物活性數(shù)據(jù)。

5. 流行病學(xué)與公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)庫(kù)

• WHO Global Health Observatory

• 世界衛(wèi)生組織的全球疾病負(fù)擔(dān)、疫苗接種等數(shù)據(jù)。

• 官網(wǎng)：https://www.who.int/data/gho

• CDC WONDER

• 美國(guó)疾控中心的死亡、傳染病、環(huán)境健康數(shù)據(jù)。

• 官網(wǎng)：https://wonder.cdc.gov/

• Our World in Data

• 全球健康、疾病和疫苗接種的可視化數(shù)據(jù)。

6. 其他特色數(shù)據(jù)庫(kù)

• SEER (Surveillance, Epidemiology, and End Results)

• 美國(guó)國(guó)家癌癥研究所的癌癥發(fā)病率和生存率統(tǒng)計(jì)。

• FAIRsharing

• 生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的標(biāo)準(zhǔn)化目錄（可檢索領(lǐng)域特定數(shù)據(jù)庫(kù)）。

注意事項(xiàng)

• 數(shù)據(jù)權(quán)限：部分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)（如UK Biobank）需申請(qǐng)并通過(guò)倫理審查。

• 數(shù)據(jù)格式：注意數(shù)據(jù)類型（如DICOM、FASTQ、CSV）及配套元數(shù)據(jù)。

• 工具支持：許多數(shù)據(jù)庫(kù)提供API或?qū)Ｓ霉ぞ撸ㄈ鏣CIA的NBIA工具）。

根據(jù)研究需求選擇合適的數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)，建議查閱相關(guān)論文或平臺(tái)文檔以確認(rèn)數(shù)據(jù)的覆蓋范圍和訪問(wèn)流程。

1. 臨床與健康大數(shù)據(jù)平臺(tái)

• 國(guó)家健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心（中國(guó)多個(gè)區(qū)域中心）

• 上海申康醫(yī)聯(lián)中心：覆蓋上海市38家三甲醫(yī)院臨床數(shù)據(jù)。

• 北京大學(xué)健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國(guó)家研究院：提供多中心臨床研究數(shù)據(jù)支持。

• 由國(guó)家衛(wèi)健委主導(dǎo)，分布在 北京、上海、江蘇、福建、山東 等地，整合了區(qū)域性醫(yī)院的電子病歷（EHR）、影像、檢驗(yàn)等數(shù)據(jù)（需申請(qǐng)權(quán)限）。

• 示例：

• 中國(guó)醫(yī)院質(zhì)量監(jiān)測(cè)系統(tǒng)（HQMS）

• 國(guó)家衛(wèi)健委醫(yī)院管理研究所主導(dǎo)，涵蓋全國(guó)三級(jí)醫(yī)院的病案首頁(yè)數(shù)據(jù)（需申請(qǐng)）。

• 中國(guó)卒中中心聯(lián)盟（CSCA）數(shù)據(jù)庫(kù)

• 全國(guó)卒中患者的臨床診療數(shù)據(jù)，用于腦血管病研究。

2. 基因組與生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

• 中國(guó)國(guó)家基因庫(kù)（CNGB, 深圳）

• 全球領(lǐng)先的綜合性基因數(shù)據(jù)庫(kù)，存儲(chǔ)中國(guó)人群基因組數(shù)據(jù)（需申請(qǐng)）。

• 官網(wǎng)：https://www.cngb.org/

• 中國(guó)人類遺傳資源共享平臺(tái)（GSA-Human）

• 由科技部支持，提供基因組、表觀組等數(shù)據(jù)（需審批）。

• 官網(wǎng)：https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/

• 國(guó)家生物信息中心（CNCB）/ 國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心（NGDC）

• 整合多個(gè)子數(shù)據(jù)庫(kù)（如GVM、GSA），涵蓋微生物、癌癥、新冠等數(shù)據(jù)。

• 官網(wǎng)：https://ngdc.cncb.ac.cn/

3. 中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫(kù)

• 中醫(yī)藥大數(shù)據(jù)中心（國(guó)家中醫(yī)藥管理局）

• 整合中醫(yī)診療方案、方劑、針灸等數(shù)據(jù)。

• TCMID (Traditional Chinese Medicine Integrated Database)

• 中藥成分、靶點(diǎn)及疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫(kù)。

• 訪問(wèn)：http://www.megabionet.org/tcmid/

• TCMSP (中醫(yī)藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù))

• 中藥活性成分、ADME參數(shù)及靶點(diǎn)預(yù)測(cè)工具。

• 官網(wǎng)：https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php

4. 疾病與流行病學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)

• 中國(guó)疾病預(yù)防控制中心（CDC）公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心

• 傳染病報(bào)告、慢性病監(jiān)測(cè)、營(yíng)養(yǎng)健康等數(shù)據(jù)（部分公開）。

• 官網(wǎng)：http://www.phsciencedata.cn/

• 中國(guó)癌癥登記中心（NCCR）

• 發(fā)布《中國(guó)腫瘤登記年報(bào)》，提供地區(qū)性癌癥發(fā)病率數(shù)據(jù)。

• 中國(guó)心血管病登記（China PEACE）

• 全國(guó)性心血管病診療和預(yù)后研究數(shù)據(jù)庫(kù)。

5. 醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)庫(kù)

• 中國(guó)醫(yī)學(xué)影像AI數(shù)據(jù)庫(kù)（如LUNA16）

• 肺部CT影像數(shù)據(jù)集，用于肺結(jié)節(jié)檢測(cè)算法開發(fā)。

• EyePACS (中國(guó)糖尿病視網(wǎng)膜病變數(shù)據(jù)集)

• 眼底圖像數(shù)據(jù)，與國(guó)際項(xiàng)目合作。

6. 其他特色資源

• 國(guó)家人口健康科學(xué)數(shù)據(jù)中心（NPHC）

• 整合臨床、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、公共衛(wèi)生等多領(lǐng)域數(shù)據(jù)（需注冊(cè)）。

• 官網(wǎng)：https://www.ncmi.cn/

• 萬(wàn)方醫(yī)學(xué)網(wǎng) / 中國(guó)知網(wǎng)（CNKI）醫(yī)學(xué)庫(kù)

• 中文醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)，含臨床指南、病例報(bào)告等。

注意事項(xiàng)

• 數(shù)據(jù)權(quán)限：國(guó)內(nèi)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)通常需通過(guò)倫理審查和行政審批（如《人類遺傳資源管理?xiàng)l例》）。

• 語(yǔ)言：部分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)僅提供中文界面。

• 區(qū)域覆蓋：不同數(shù)據(jù)庫(kù)的地域代表性差異較大（如城鄉(xiāng)差異）。

如果需要使用這些數(shù)據(jù)庫(kù)，建議通過(guò)官方渠道聯(lián)系相關(guān)機(jī)構(gòu)，并關(guān)注 國(guó)家科技資源共享服務(wù)平臺(tái)（https://www.escience.org.cn/）的最新動(dòng)態(tài)。

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